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原因としては、
・特定肥料成分の減少
・線中等、有害微生物の増加
・アレロパシー（成長阻害）物質の増加 など
対策としては
・有機物の大量投入
・土壌殺菌（高温、湛水）
・コンパニオンプランツの導入（マリーゴールドなど）
・接ぎ木品種の導入 などが考えられます。
なお、輪作や土の入れ替えは実行できる人が限られますし、それが出来ないから皆さん困ってると思いますので、本スレでは話題から除外したいと思います。